Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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