Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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FAM208BQ5VWN6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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FAM208BQ5VWN6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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FAM208BQ5VWN6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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FAM208BQ5VWN6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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FAM208BQ5VWN6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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FAM208BQ5VWN6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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FAM208BQ5VWN6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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FAM208BQ5VWN6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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FAM208BQ5VWN6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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FAM208BQ5VWN6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM208BQ5VWN6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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