Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FAM78BQ5VT40 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FAM78BQ5VT40 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FAM78BQ5VT40 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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