Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZC3H13Q5T200 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZC3H13Q5T200 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZC3H13Q5T200 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZC3H13Q5T200 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZC3H13Q5T200 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms