Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP170Q5SW79 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP170Q5SW79 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms