Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms