Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms