Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER1Q5JTC6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER1Q5JTC6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms