Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP27-1Q3LI81 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms