Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPHKAPQ2M3C7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPHKAPQ2M3C7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
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