Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK5Q16478 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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