Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms