Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ZFHX3Q15911 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZFHX3Q15911 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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