Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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