Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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