Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRKQ15262 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
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PTPRKQ15262 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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PTPRKQ15262 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
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