Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCM1Q15154 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms