Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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