Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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