Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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