Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CDK13Q14004 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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