Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCINQ13939 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCINQ13939 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCINQ13939 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCINQ13939 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCINQ13939 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCINQ13939 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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CCINQ13939 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCINQ13939 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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