Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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