Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAPSNQ13702 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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