Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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