Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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