Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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TCOF1Q13428 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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TCOF1Q13428 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCOF1Q13428 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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TCOF1Q13428 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
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TCOF1Q13428 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
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TCOF1Q13428 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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TCOF1Q13428 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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TCOF1Q13428 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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TCOF1Q13428 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
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