Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MSLNQ13421 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSLNQ13421 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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