Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATMQ13315 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATMQ13315 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATMQ13315 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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