Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms