Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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