Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN3Q13064 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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