Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PRDM2Q13029 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRDM2Q13029 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
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