Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP160Q12769 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP160Q12769 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms