Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms