Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PUDPQ08623 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms