Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms