Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms