Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA3Q08378 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA3Q08378 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms