Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms