Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms