Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms