Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLE4Q04727 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TLE4Q04727 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms