Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA6Q01524 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms