Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKP1P63208 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKP1P63208 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKP1P63208 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKP1P63208 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKP1P63208 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKP1P63208 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP1P63208 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP1P63208 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP1P63208 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms