Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO4P61968 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO4P61968 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms