Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SPCS3P61009 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPCS3P61009 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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