Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTBP60709 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTBP60709 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTBP60709 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTBP60709 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTBP60709 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTBP60709 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTBP60709 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTBP60709 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTBP60709 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTBP60709 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms