Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3BP58499 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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