Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF3P57682 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF3P57682 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms